Domaines
Biophysics
Type of internship
Expérimental Description
Les virus sont des agents biologiques étonnants constitués de centaines de briques élémentaires assemblées avec une précision atomique. Le projet de stage a pour objectif d’élucider la dynamique à l’équilibre de l’empaquetage du génome dans une capside virale icosaédrique à l’échelle de la molécule unique. Nous disposons d’un montage optique quasi unique combinant la microscopie de fluorescence à réflexion totale interne (TIRFM) et la microscopie interférométrique à diffusion (iSCAT) permettant de visualiser en temps réel des molécules par fluorescence et des molécules non nécessairement marquées par diffusion de la lumière. Des échantillons biologiques seront préparés puis des mesures par TIRFM/iSCAT seront réalisées à différentes concentrations en protéines virales. Les images seront analysées via d’éventuelles améliorations sur les codes existants pour déduire ensuite les grandeurs thermodynamiques. Idéalement, nous recherchons à estimer l’énergie libre d’interaction en fonction de l’état d’assemblage de la particule virale. Enfin, des expériences d’auto-assemblage en présence d’un agent d’encombrement seront initiées afin de s’approcher des conditions physicochimiques du milieu intracellulaire.
Contact
Guillaume TRESSET